This is an old revision of the document!
Oppdatering av algoritmer og metadata i Kvalobs
PROSEDYRE FOR Å OPPDATERE/LEGGE INN NYE SKRIPT/METADATA
Oppdatering gjøres hver dag fom. mandag tom. fredag i tidsrommet kl.11:20 - 11:40 norsk lokaltid.
Nye metoder for daglig oppdatering
Metakvalobs: Generering av metadata pakker for kvalobs fra kvalobs bruker: halvautomatisk
Midlertidig:
ssh -Y kvalobs@157.249.168.104
Undersøk at alt er gått greit
Ser kjøringen grei ut:
view_auto.sh
Dersom det står “Fortsett” nederst i $HOME/var/log/auto.log filen skal en fortsette, ellers så skal en avslutte
( Er dette dagens dato?: ls -l $HOME/var/log/auto.finished_log )
( Dersom ikke dette er dagens dato avsluttes oppdateringen og det meldes i fra om feil i kjøringen av auto.sh. )
( Er det noen endringer i fra klima ser vi nederst i $HOME/var/log/auto.log eller en kan utføre: grep ulike $HOME/var/log/run_klima2kvalobs_all.log )
Dette er ukes/månedsrutine for ekstra sikkerhet:
myuser er f.eks oysteinl scp /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_UTF8.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist_SVV/kvmeta_SVV.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist_PROJ/kvmeta_PROJ.tar.bz2 myuser@repo.met.no:/var/www/repo/data/metadata/obs/kvalobs
Produksjonsmaskin ( xenial ):
OBS! Den dagen de skifter mellom kvalobs-a1 og kvalobs-b1, oppdaterer vi ikke metadata.
Logg så inn som bruker kvalobs på kvalobs (som altså nå er kvalobs-a1 eller kvalobs-b1).
/metno/kvalobs/bin/kvget_metadata_all
Alternativt
Stopp kvalobs med: kvstop
Innstaller de nye metadataene med: /metno/kvalobs/bin/kvget_metadata
( gammel løsning Eksekver insert.sh (opdaterer QC1-0 etc).)
Start kvalobs med: kvstart
Dersom veldig mye går galt og en har behov for å hente ned metadata fra repo.met.no
Stopp kvalobs med: kvstop
Innstaller de nye metadataene med: /metno/kvalobs/bin/kvget_metadata_repo
( gammel løsning Eksekver insert.sh (opdaterer QC1-0 etc).)
Start kvalobs med: kvstart
Histkvalobs (virtuell maskin) hovedløsning:
Utføres på histkvalobs:
Stopp kvalobs med: kvstop
Utføres på histkvalobsdb:
Logg inn som kvalobs bruker på histkvalobsdb, deretter utfør:
Innstaller de nye metadatene med: /home/kvalobs/bin/kvget-metadata
Oppdaterer QC1-4-109: psql -f ~/Update-Checks-QC1-4-109.sql
Utføres på histkvalobs:
Start kvalobs med: kvstart
Det å kunne stopp/legge tilbake dataflyt fra svvdata gjennom hovedkvalobs
Metakvalobs
Ved stans av svvdataflyten inn i hovedkvalobs få bort svvdata fra obs_pgm
filen ~/bin/auto.sh ENDRES
FRA
# cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_METNO.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta.tar.bz2 # cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_METNO_UTF8.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_UTF8.tar.bz2 cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist_METNOSVV/kvmeta_METNOSVV.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta.tar.bz2 cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist_METNOSVV/kvmeta_METNOSVV_UTF8.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_UTF8.tar.bz2
TIL
cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_METNO.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta.tar.bz2 cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_METNO_UTF8.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_UTF8.tar.bz2 # cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist_METNOSVV/kvmeta_METNOSVV.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta.tar.bz2 # cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist_METNOSVV/kvmeta_METNOSVV_UTF8.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_UTF8.tar.bz2
Ved oppstart av svvdataflyten inn i hovedkvalobs få generert svvdata i obs_pgm
filen ~/bin/auto.sh ENDRES
FRA
cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_METNO.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta.tar.bz2 cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_METNO_UTF8.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_UTF8.tar.bz2 # cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist_METNOSVV/kvmeta_METNOSVV.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta.tar.bz2 # cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist_METNOSVV/kvmeta_METNOSVV_UTF8.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_UTF8.tar.bz2
TIL
# cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_METNO.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta.tar.bz2 # cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_METNO_UTF8.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_UTF8.tar.bz2 cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist_METNOSVV/kvmeta_METNOSVV.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta.tar.bz2 cp -pv /usr/share/kvalobs/metadist_METNOSVV/kvmeta_METNOSVV_UTF8.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta_UTF8.tar.bz2
Rutiner som gjøres automatisk på Metakvalobs og som må gjøres utenom tidspunktet for daglig oppdatering av metadata
kvalobs@metakvalobs:~$ crontab -l
# m h dom mon dow command
44 5 * * 2,3,4,5 $HOME/bin/run_klima2kvalobs_all
44 5 * * 1 $HOME/bin/run_QC1-1_all
# 51 * * * * $HOME/bin/run_klima2kvalobs_all
kvalobs@metakvalobs:~$ cat $HOME/bin/run_klima2kvalobs_all
#! /bin/sh
export HOME=/metno/kvalobs
$HOME/bin/run_klima2kvalobs
$HOME/bin/run_QC1-1_all
Nye grenseverdier: QC1-1_all.out blir generert i cronjobben over ($HOME/bin/run_QC1-1_all) , men kan genereres manuelt
Logg inn som egen bruker på metakvalobs.
Oppdater metadata fra git:
sk /metno/kvalobs/bin/git_pull
Hvis noen av statuslinjene starter med C ( dette betyr konflikt) skal en slette disse filene og deretter gjøre en ny git pull.
( cd gjerne til git repositoriet først: cd $METADIR. Bruk kommandoen rm eks: sudo -u kvalobs rm station/station.out )
Generer filen QC1-1_all.out og flytter den over til riktige kataloger med:
sk /metno/kvalobs/bin/run_QC1-1_all
For testing
Staging server blir ikke automatisk oppdatert (Test-maskin), oppdatering som stemmer ( mer ) med det som er i drift:
Årsaken til at Staging server ikke blir automatisk oppdatert er bruken av egne metadata for testing.
crontab -l # 45 11 * * * $HOME/bin/kvget-metadata-cron > /dev/null 2>&1 %
Dersom en ønsker en oppdatering som stemmer ( mer ) med det som er i drift utfør:
cd $HOME $HOME/bin/kvget-metadata-cron
Manuell testing av egne innlagte metadata (test-maskin):
$ cd myuser $ . bashrc_myuser
Gå til katalogen $METADIR: cd $METADIR
Oppdater metadata fra git: git pull
Hvis vi får CONFLICT ( dette betyr konflikt) skal en slette disse filene og deretter gjøre en ny git pull.
Dersom det er filer du jobber med så må de tas vare på utenfor repositoriet og kopieres inn på riktig sted.
Hvis du har en endring, kopierer du den inn her:
( f.eks: scp geok06_sms_snowdepth_increase_no_snowsymbol.pl kvalobs@xxx:~/kvoss_intern/kvmeta/algorithms$ )
Overfør de nye metadataene til /usr/share/kvalobs/metadata med skriptet: kvinstall_metadata
Stopp kvalobs med: kvstop
Innstaller de nye metadatene med: /usr/lib/kvalobs-metadata/bin/run_metadata
Eksekver insert.sh (opdaterer QC1-0 etc).
Start kvalobs med: kvstart
Overføring av metadata i fra /usr/share/kvalobs/metadata til databasen; avgrensede og kjappere metoder
En kan få kjapt lagt inn alle algoritmer i databasen
LIBEXECDIR=/usr/lib/kvalobs-metadata/bin $LIBEXECDIR/run_algorithm_all
alle manuelle checks
LIBEXECDIR=/usr/lib/kvalobs-metadata/bin $LIBEXECDIR/run_checks_all
alle manuelle station_param
LIBEXECDIR=/usr/lib/kvalobs-metadata/bin $LIBEXECDIR/run_station_param_all
Rutiner som "kvalobs bruker" på metakvalobs
Rutiner som gjøres sjeldent
Alle disse rutinene uføres på kvalobs@metakvalobs.
QC1-1_all.out
Denne operasjonen må gjøres hver gang noen filer på $METADIR/station_param/station_param_auto oppdateres som inneholder QC1-1 i filnavnet.
$ cd myuser $ . bashrc_myuser
Gå til katalogen $METADIR/station_param/station_param_auto:
$ cd $METADIR/station_param/station_param_auto
Oppdater metadata fra git:
$ git pull
Hvis konflikt skal en slette disse filene og deretter gjøre en ny git pull.
Generer filen QC1-1_all.out lokalt med:
$ /usr/lib/kvalobs-metadata/bin/run_QC1-1_all
Til slutt lagres den nye filen i versjonskontrollsystemet
$ git commit QC1-1_all.out $ git pull
Metakvalobs: Generering av metadata pakker for kvalobs fra kvalobsbrukeren ( er ikke tiltenkt for daglig oppdatering )
Logg inn som bruker kvalobs på metakvalobs.
Gå til katalogen $METADIR: cd $METADIR
Oppdater metadata fra git: git pull
Hvis noen av statuslinjene starter med C ( dette betyr konflikt) skal en slette disse filene og deretter gjøre en ny git pull.
Innstaller data fra stinfosys: /usr/lib/kvalobs-metadata/bin/run_stinfosys2kvalobs_new
Deretter oppdater git med nye metadata fra stinfosys: git commit; git push
Overfør de nye metadataene til /usr/share/kvalobs/metadata med skriptet: /metno/kvalobs/bin/kvinstall_metadata
Innstaller de nye metadataene med: /usr/lib/kvalobs-metadata/bin/run_metadata
Overføring av metadata til repositoriet slik at andre kan laste det ned:
scp /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta.tar.bz2 myuser@repo.met.no:/var/www/repo/data/metadata/obs/kvalobs
Andre metoder for daglig oppdatering
Metakvalobs: Generering av metadata pakker for kvalobs fra egen bruker
Logg inn som egen bruker på metakvalobs.
Oppdater metadata fra git:
sudo -u kvalobs /metno/kvalobs/bin/git_pull
Dersom konflikt skal en slette disse filene og deretter gjøre en ny git pull.
( cd gjerne til git repositoriet først: cd $METADIR. Bruk kommandoen rm )
Innstaller data fra stinfosys:
sudo -u kvalobs /metno/kvalobs/bin/run_stinfosys2kvalobs
Deretter oppdater git med nye metadata fra stinfosys:
sudo -u kvalobs /metno/kvalobs/bin/git_copy_commit_push
På dette punktet i oppdateringen, dersom de tre foregående kommandoene gir resultatet at det ikke er noen nye metadata (første kommando gir i så fall kun utskrift 'At revision …') så er det ikke kommet noen nye metadata og oppdateringen avbrytes.
Overfør de nye metadataene til /usr/share/kvalobs/metadata med skriptet og innstaller de nye metadataene med:
sudo -u kvalobs /metno/kvalobs/bin/kvmeta_all
Overføring av metadata til repositoriet slik at andre kan laste det ned:
scp /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist_SVV/kvmeta_SVV.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist_PROJ/kvmeta_PROJ.tar.bz2 repo.met.no:/var/www/repo/data/metadata/obs/kvalobs
Metakvalobs: Generering av metadata pakker for kvalobs fra egen bruker med: alias sk='sudo -u kvalobs'
Logg inn som egen bruker på metakvalobs.
Oppdater metadata fra git:
sk /metno/kvalobs/bin/git_pull
Dersom konflikt skal en slette disse filene og deretter gjøre en ny git pull.
( cd gjerne til git repositoriet først: cd $METADIR. Bruk kommandoen rm )
Innstaller data fra stinfosys:
sk /metno/kvalobs/bin/run_stinfosys2kvalobs
Deretter oppdater git med nye metadata fra stinfosys:
sk /metno/kvalobs/bin/git_copy_commit_pull
På dette punktet i oppdateringen, dersom de tre foregående kommandoene gir resultatet at det ikke er noen nye metadata så er det ikke kommet noen nye metadata og oppdateringen avbrytes.
Overfør de nye metadataene til /usr/share/kvalobs/metadata med skriptet og innstaller de nye metadataene med:
sk /metno/kvalobs/bin/kvmeta_all
Overføring av metadata til repositoriet slik at andre kan laste det ned:
scp /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist_SVV/kvmeta_SVV.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist_PROJ/kvmeta_PROJ.tar.bz2 repo.met.no:/var/www/repo/data/metadata/obs/kvalobs
Metakvalobs: Generering av metadata pakker for kvalobs fra kvalobs bruker
Logg inn som egen bruker på metakvalobs.
sudo -i -u kvalobs . .bashrc
Oppdater metadata fra git:
/metno/kvalobs/bin/git_pull
Dersom konflikt skal en slette disse filene og deretter gjøre en ny git pull.
( cd gjerne til git repositoriet først: cd $METADIR. Bruk kommandoen rm )
Innstaller data fra stinfosys:
/metno/kvalobs/bin/run_stinfosys2kvalobs
Deretter oppdater git med nye metadata fra stinfosys:
/metno/kvalobs/bin/git_copy_commit_push
På dette punktet i oppdateringen, dersom de tre foregående kommandoene gir resultatet at det ikke er noen nye metadata så er det ikke kommet noen nye metadata og oppdateringen avbrytes.
Overfør de nye metadataene til /usr/share/kvalobs/metadata med skriptet og innstaller de nye metadataene med:
/metno/kvalobs/bin/kvmeta_all
Overføring av metadata til repositoriet slik at andre kan laste det ned:
logout scp /usr/share/kvalobs/metadist/kvmeta.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist_SVV/kvmeta_SVV.tar.bz2 /usr/share/kvalobs/metadist_PROJ/kvmeta_PROJ.tar.bz2 repo.met.no:/var/www/repo/data/metadata/obs/kvalobs